“構”應先于“建”，只有“構”清楚了，才可以開始“建”。就是用專業的手段將抽象構思進行具體實現的過程，包括實驗室設計、安裝、調試、維護和升級等。

目前，我國對實驗室的建設沒有相關的建筑規范，因此很多實驗室在土建設計階段，沒有充分考慮到實驗室對建筑的特殊要求。正確的實驗室建設流程是首先進行實驗室的工藝設計，然后在滿足實驗室工藝要求的前提下，進行實驗室的土建設計。這就要求建設單位咨詢專業的實驗設計方，在項目的土建設計階段，就及時介入。如有可能最好帶土建設計師一起參觀其他單位的實驗室以加深其認識。

比較典型的土建設計問題包括：

1）未設計風井，或者風井的位置、大小、數量不能滿足要求；

2）未考慮氣瓶室，僅按消防用氣瓶室設計；

3）未對實驗室進行整體的平面規劃，分區過于簡單或不合理；

4）未考慮儀器的使用情況；

5）未考慮特殊房間功能，如恒溫恒濕室等；

6）凈層高過低，影響管線布局，裝修后空間低矮。